Perspectives de la bioinformatique

Le DESS en bioinformatique à l'Université du Québec à Montréal a pour objectif la formation de spécialistes en bioinformatique. Notre programme offre aux étudiants la possibilité d'acquérir de nouvelles connaissances en biologie et informatique nécessaires pour oeuvrer dans le domaine des biotechnologies.

L'essor de la génomique et de la protéomique rend indispensable la formation de spécialistes capables d'intégrer les connaissances issues des biosciences et de l'informatique. Le besoin de nouvelles approches et méthodes analytiques pour explorer l'importante quantité de données biologiques générées constitue un défi pour les candidats ayant des formations en mathématiques ou en informatique. La maîtrise de nouveaux et puissants outils permettra aux biologistes et aux biochimistes d'explorer de nouveaux champs de recherche.

L'expansion de la biotechnologie dans le monde, au Canada, et particulièrement au Québec, offre des perspectives d'emploi intéressantes dans un domaine à la pointe de la technologie, que ce soit dans la recherche ou dans l'industrie. Les besoins en personnel qualifié en bioinformatique touchent des domaines aussi divers que l'industrie pétrolière, minière, forestière, sans oublier la génomique, la pharmaceutique, l'industrie alimentaire et agricole, ainsi que la recherche fondamentale.

À la fin de leur formation, les étudiants du DESS ont la possibilité d'effectuer un stage dans une entreprise de biotechnologies ou dans un laboratoire de recherche, situés dans la région de Montréal. Plusieurs étudiants des premières promotions ont, par la suite, poursuivi leur carrière au sein de ces entreprises et laboratoires.

Industrie de biotechnologie au Québec

Selon le site d'Investissement Québec l'industrie montréalaise de biotechnologie se trouve en pleine expansion.

Montréal est le moteur de la génomique au Canada. On y trouve des centres de recherche de renommée internationale, dont :

• Usine Moderna à Montréal : 100 millions de doses de vaccin ARNm par année.
• Le Centre d'innovation Génome Québec et Université McGill, composé de cinq plates-formes technologiques inter-reliées offrant une vaste gamme de services de génotypage, de micro-puces à ADN, de pharmacogénomique, de protéomique et de séquençage.
• L'Institut de recherche en biotechnologie, le plus important centre de R-D en biotechnologie au Canada, fait partie du Conseil national de recherche du Canada et compte 800 employés.
• La plateforme protéomique du Centre de génomique de Québec, situé au centre de recherche du CHU de Québec.

Les centres de recherche importants suivants existent aussi au Québec :

• Biotech-Angus.
• Campus des technologies de la santé (CTS).
• Carrefour d'innovation en matériaux industriels (CIMI) - Institut des matériaux industriels.
• Centre de développement des biotechnologies (CDB) : Laval, Lévis, Sherbrooke et St-Hyacinthe (admissible à des crédits d'impôt particuliers).
• Centre d'innovation Génome Québec et Université McGill, incubateur.
• Centre québécois d'innovation en biotechnologie (CQIB), incubateur.
• Cité de la biotechnologie en santé humaine du Montréal métropolitain.
• Complexe scientifique de l'Université du Québec à Montréal (UQAM).
• Institut de recherche en biotechnologie (IRB).
• Institut de recherche en immunologie et en cancérologie (IRIC), Université de Montréal.
• Parc technologique du Québec métropolitain.
• Incubateur J.-Armand-Bombardier, Université de Montréal, École Polytechnique.
• Technoparc Montréal.

Industrie pharmaceutique au Québec

Une vingtaine d'entreprises pharmaceutiques internationales ont établi leur siège social canadien au Québec. Parmi les plus importantes, on trouve :

• AstraZeneca
• Boehringer Ingelheim
• Bristol-Myers Squibb
• GSK Biologicals
• Laboratoires Abbott
• Moderna
• Novartis
• Pfizer Canada
• Sanofi-aventis Canada
• Servier
• Shire
• Vertex Pharmaceuticals Canada
• Warnex

Le Québec est le centre de la recherche fondamentale au Canada. Cinq sociétés pharmaceutiques internationales y mènent des projets de recherche poussés dans leurs centres privés de R-D.

Plus de 2 000 chercheurs impliqués directement dans la découverte et la mise au point de molécules thérapeutiques œuvrent au Québec tant en pharmaceutique, qu'en biotechnologie et en chimie médicinale.

Bon nombre de médicaments ont été découverts et mis au point au Québec :

• le 3TC, l'un des médicaments les plus prescrits dans le traitement du sida est issu des laboratoires de Biochem;
• le laboratoire de recherche de Merck à Montréal a donné naissance à deux des cinq médicaments vedettes de la société, dont Singulair;
• parmi les découvertes importantes de Pfizer Canada, deux ont eu lieu au Canada : le principal traitement d'hormonothérapie substitutive du monde et un nouvel immunosuppresseur utilisé pour éviter le rejet des greffons.

Biotechnologie Mondiale

Selon "Ernst&Young":

Strong product pipelines and product success, record-breaking financing totals, unprecedented deal activity and impressive financial results mark historic industry advances.

Le Canada se remarque par la plus forte hausse des revenus (22%) par rapport aux É-U et l'Europe (14%).

Le secteur canadien de la biotechnologie

Selon "Gouvernement du Canada":

Le Canada est un acteur clé du secteur mondial de la biotechnologie, où il occupe une place de plus en plus importante. Selon Ernst & Young, 82 sociétés canadiennes de biotechnologie cotées en bourse ont généré des recettes totales de 3,2 milliards de dollars américains, ce qui représente 4,4% du chiffre d'affaires mondial dans le secteur. Avec des dépenses de recherche-développement (R-D) de 885 millions de dollars américains, ces sociétés ont réalisé plus de 3% des dépenses mondiales de R-D dans les biotechnologies.

En comptant ses 465 sociétés privées de biotechnologie, le Canada abrite presque 11% des entreprises de biotechnologie du monde. PricewaterhouseCoopers a établi récemment que dans le secteur de la biotechnologie, le Canada est le pays où le nombre d'emplois en R-D, le nombre de demandes de brevets d'origine étrangère et les sommes affectées à la R-D à des fins commerciales augmentent le plus rapidement.

La majorité des sociétés canadiennes de biotechnologie oeuvrent essentiellement dans les produits et les applications touchant la santé humaine, mais les segments de l'agriculture, de l'environnement et de l'industrie ne sont pas en reste. De nombreuses entreprises installées au Canada oeuvrent activement à la mise en application et la commercialisation de biotechnologies novatrices.

La croissance du secteur est propulsée par de petites et moyennes entreprises, souvent dans des domaines non traditionnels de la biotechnologie. Les entreprises comptant 49 employés ou moins représentaient 75% du total.

Place de la bioinformatique

La bioinformatique est une force importante du secteur canadien de la biotechnologie. Ce segment comprend la génomique et les domaines qui y sont liés, l'ingénierie tissulaire et la technologie liée à la découverte de médicaments ainsi que les services. Bioinformatics Solutions, DNA LandMarks et Kinexus Bioinformatics comptent parmi les entreprises canadiennes de bioinformatique

Selon le rapport "Global Bioinformatics Market Outlook" de RNCOS :

• la génomique occupe la majeure partie des applications bioinformatiques.
• le développement du secteur de la Technologie de l'information et de l'Internet ont contribué à la croissance de l'industrie bioinformatique.
• la modélisation moléculaire appliquée à la recherche des médicaments peut économiser jusqu'à 30% du cout et du temps nécessaires pour découvrir de nouveaux médicaments.

Bioinformatique au Québec

Au Québec, il y a de nombreuses entreprises qui se spécialisent en bioinformatique. Par exemple, pratiquement toutes les entreprises de biotechnologies emploient des bioinformaticiens. La bioinformatique joue un très grand rôle dans l'avenir de la biologie. Entre autre, dans la comparaison de séquences et la reconstruction de génomes. C'est principalement dans les secteurs pharmaceutique et médical qu'on retrouve des bio-informaticiens de même que dans les secteurs des produits de diagnostics et des procédés biologiques.

Biotechnologie au Québec

Selon "Gouvernement du Canada":

La principale grappe biotechnologique canadienne est située à Montréal (QC).

Plus de 180 moyennes et grandes entreprises de biotechnologie publiques et privées sont établies au Québec. Elles emploient 4 500 personnes et ont réalisé des dépenses de R-D dans la biotechnologie de l'ordre de 560 millions de dollars. Montréal est un centre international particulièrement important du développement génomique. Le Centre d'innovation Génome Québec à l'Université McGill, l'Institut de recherche en biotechnologie, le Centre Robert-Cedergren et le Centre protéomique du Québec sont des centres de recherche de calibre mondial.

AstraZeneca, DSM Biologics, Merck et ProMetic Life Sciences comptent parmi les grandes entreprises de biotechnologies qui exercent des activités à Montréal.

Selon "CNRC,Conseil National de Recherches Canada":

Siège de la plus forte concentration d'activités de R-D en biotechnologie au Canada, Montréal est aussi l'emplacement de l'une des plus importantes grappes au monde dans le secteur des sciences de la vie en évolution rapide. Cette grappe montréalaise peut s'enorgueillir de ses quelques 540 entreprises procurant du travail à plus de 37 000 personnes et de ses 125 centres de recherche dont l'effectif global croît au rythme de 2 000 emplois par année.

La grappe montréalaise du secteur des sciences de la vie a attiré des investissements de plus de 400 millions de dollars au cours des trois dernières années et compte le nombre le plus élevé d'entreprises en démarrage dans le secteur de la biotechnologie au Canada.

La masse critique d'activités dans le secteur montréalais des sciences de la vie est renforcée par la présence de douzaines de grandes sociétés pharmaceutiques transnationales dont plusieurs géants comme les Laboratoires Abbott Limitée et Bristol-Myers Squibb.

La capacité scientifique de la collectivité repose sur la présence d'un bon nombre d'organisations de recherche mondialement reconnues comme l'Institut neurologique de Montréal, l'Institut de recherches cliniques de Montréal, les laboratoires de recherche du Centre hospitalier de l'Université de Montréal, l'Institut de cardiologie de Montréal, l'Institut Armand-Frappier et l'Institut de recherche en biotechnologie du CNRC (IRB-CNRC).

Ensemble, toutes ces organisations ont aidé la grappe en sciences de la vie de Montréal à occuper une place prépondérante dans la recherche sur les maladies cardiovasculaires, en épidémiologie, en immunologie, en neurologie, en neurobiologie, en oncologie et en virologie.

Le Québec est une balise de la biotechnologie au Canada. Selon Statistique Canada, 30% des entreprises de biotechologies sont établies au Québec.

Le Canada est le pays du G7 qui a enregistré le taux de croissance le plus rapide quant au nombre de travailleurs dans le domaine de la R-D, aux demandes de brevets de l'extérieur et aux dépenses en R-D. La capacité croissante du Canada au chapitre de la R-D biopharmaceutique est une évolution normale de nos activités de recherches, qui ont acquis une renommée internationale dans des domaines tels que la génomique, la protéomique, la bioinformatique, les cellules souches, les immunothérapies, le génie protéique et les nouveaux systèmes d'administration de médicaments. Seize universités canadiennes sont affiliées à un réseau de plus de 100 hôpitaux universitaires et instituts de recherche.

Les sociétés canadiennes de biotechnologie continuent de diversifier leurs produits et procédés et d'être actives dans divers sous-secteurs de la biotechnologie. De même, les activités de recherche des universités et des hôpitaux universitaires canadiens présentent d'importantes occasions commerciales. Au Canada, plus de 500 produits biopharmaceutiques sont actuellement à diverses étapes du développement, qui vont de la recherche à la mise en marché.

Pharmaceutique

Selon "R&D,CanadaPharma":

Voici quelques exemples des contributions économiques et des investissements réalisés jusqu'à présent par les compagnies membres de R-D au Canada.

• L'industrie pharmaceutique du Canada emploie au-delà de 22 000 employés
• Les compagnies membres de R-D contribuent de manière substantielle à la création d'emplois au Canada. PricewaterhouseCoopers Canada a estimé que plus de 35 200 emplois indirects, ainsi que plus de 41 700 emplois induits (emplois résultant des revenus des emplois directs et indirects affectés aux dépenses de consommation) sont créés par les compagnies membres de R-D

Sources

• Investissement Québec, Investissement Québec
• Outlook, Global Bioinformatics Market Outlook
• BIOQuébec, Enquête annuelle sur l'état de l'industrie de la vie au Québec
• Les nouvelles de la Biotechnologie au Québec 2022